Sous l'autorité du Directeur général du Budget, la Direction du Contrôle interne a pour missions :
- le contrôle de l'application des règles d'organisation et de fonctionnement des services de la Direction générale ;
- l'assistance au Directeur général dans la surveillance et l'animation des services, notamment par le suivi de l'exécution des directives qu'il leur adresse ;
- le contrôle de l'existence et de l'application de normes et procédures internes dans les structures de la Direction générale ;
- le contrôle de l'application des lois et règlements ;
- le contrôle de l'application des instructions et directives présidentielles ou primatorales
- la vérification de l'utilisation des crédits publics et la régularité des opérations effectuées par les administrateurs de crédits ;
- l'assistance au Directeur général dans le contrôle de la gestion du personnel et du matériel de l'ensemble des services placés sous sa responsabilité ;
- la proposition de mesures aptes à améliorer la qualité du service et à accroître son rendement;
- l'examen, pour avis, des projets de textes législatifs et réglementaires initiés au niveau de la Direction générale ;
- le suivi de l'application des directives issues des missions des corps et organes de contrôle de l'état ainsi que de celles découlant de ses propres missions ;
- la mise en place de stratégies pour une bonne utilisation de l'outil informatique dans ses missions et leur évaluation ;
- la conduite de toute mission d'étude, d'enquête, de vérification ou de contrôle qui lui est confiée par le Directeur général ;
- l'audit des services et l'évaluation ex-post des plans, projets, programmes et réformes mis en Å“uvre à la Direction générale ;
- la promotion au sein des services des meilleurs standards internationaux dans les domaines relevant du champ de compétence de la Direction générale.
La Direction du Contrôle interne comprend :
- la Division de la Synthèse et de la Documentation ;
- la Division de l'Audit et du Contrôle de Gestion ;
- la Division du Suivi de la Performance ;
- le Bureau administratif et financier.